传染性非典型肺炎的潜伏期大约为1-14天，一般在4-5天发病。病人起病急，以发热为首发症状，体温一般高于38℃，偶有畏寒；可伴有头痛、关节酸痛、肌肉酸痛、乏力、腹泻；可有咳嗽，多为干咳、少痰、偶有血丝痰，也可能胸闷；严重者出现呼吸加速，气促，或明显呼吸窘迫。有明显的家庭和医院内聚集现象。